Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms