Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms