Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms