Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms