Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MC1RQ01726 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms