Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms