Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTG1P63261 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACTG1P63261 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms