Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN17P56750 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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