Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP9P55211 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP9P55211 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP9P55211 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms