Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF6P49848 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms