Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP153P49790 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP153P49790 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP153P49790 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP153P49790 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP153P49790 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP153P49790 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP153P49790 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP153P49790 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP153P49790 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms