Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLK1P49759 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLK1P49759 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLK1P49759 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms