Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms