Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRXP46100 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRXP46100 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms