Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP5P45974 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP5P45974 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP5P45974 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP5P45974 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms