Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms