Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms