Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms