Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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HOXD3P31249 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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HOXD3P31249 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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HOXD3P31249 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXD3P31249 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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