Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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