Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms