Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms