Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms