Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms