Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DMDP11532 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DMDP11532 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DMDP11532 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DMDP11532 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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