Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms