Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAPGEF3O95398 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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