Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms