Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms