Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms