Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms