Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H7C1D1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H7C1D1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H7C1D1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H7C1D1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H7C1D1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H7C1D1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H7C1D1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms