Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms