Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DGG1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DGG1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms