Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A8MVJ9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms