Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms