Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms