Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG4Q9ULP0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms