Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPC1L1Q9UHC9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms