Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms