Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHPF2Q9P2E5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms