Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms