Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMTM6Q9NX76 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms