Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms