Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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