Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
NOP10Q9NPE3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NOP10Q9NPE3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms