Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms