Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms