Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms