Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRIP1Q9BX63 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms